Fungicidy jsou klasifikovány podle způsobu jejich použití

1. Ochranný prostředek
Před kontaktem patogenních mikroorganismů s rostlinou nebo ponořením rostliny je rostlina nebo okolní prostředí ošetřeno léčivem, které inhibuje klíčení patogenních spor nebo zabíjí vyklíčené patogenní spory, aby byla rostlina chráněna před poškozením. Tento efekt se nazývá ochranný efekt. Prostředky s tímto účinkem jsou ochranné prostředky. Jako je směs Bordeaux, zinek zinek, síran měďnatý, měď ze zeleného mléka, mancozeb, chlorothalonil a tak dále.
2. Terapeutické prostředky
Patogenní mikroorganismy terapeutického činidla infiltrovaly rostlinu, ale rostlina vykazuje příznaky a je v inkubační době. Droga proniká do rostlinné tkáně z epidermis rostliny a zabíjí nebo inhibuje patogen prostřednictvím transdukce, difúze nebo produkce metabolitů, takže nemocná rostlina již nebude trpět a obnoví zdraví. Činidla, která mají tento terapeutický účinek, se nazývají terapeutická nebo chemoterapeutická činidla. Jako je thiophanate-methyl, karbendazim, kasugamycin a tak dále.
3. Eradikační činidlo
Eradikanty se týkají patogenů, které mohou přímo zabíjet patogeny, které napadly rostliny, když jsou aplikovány poté, co byly rostliny infikovány. Činidla s takovým eradikačním účinkem jsou eradikační činidla. Jako je thiram, pentachlorfenát sodný, vápenná síra a tak dále.